紫斑牡丹株形高大，生长势极强，其高生长可达三至四米。紫斑牡丹花的最明显特征是花瓣基部有较大块状的紫黑斑，紫斑牡丹由此而得名，也是区别紫斑牡丹与中原牡丹的主要依据。现在新育杂交品种中出现了许多具有紫红斑和棕红斑的品种。

有学者提出紫斑牡丹与中原牡丹相比，品种中单瓣型品种多，重瓣型品种少，这种说法不太准确。造成这种认识的原因是繁殖方式的不同，并非紫斑牡丹的本质特性，由于中原牡丹品种繁殖方式以嫁接为主，所以人为的选择性因素导致多年来繁育的品种目标性很强，什么品种好就繁育什么品种，年复一年，选优淘劣，形成了目前以重瓣为多的系列品种。而甘肃紫斑牡丹历来以播种繁殖为主，分根繁殖为副。观赏牡丹种植

从紫斑牡丹生长习性来看，越是重瓣的品种，坐果（结实）率越低、产生种子很少甚至不结种子。这样年复一年的播种，有什么苗栽什么苗，形成单瓣品种越来越多。重瓣和半重瓣品种却无法增加，虽然简单的分株繁殖方法能保持原品种性状，但却无法达到快速繁殖的目的。庭院牡丹

因此，改变繁殖方式，加强无性嫁接繁殖是改变品种结构单一的主要措施。近年来兰州中川牡丹园采用自研适合紫斑牡丹繁殖的嫁接技术，大量繁殖优良品种，有针对性地繁育重瓣品种，初步改变了甘肃牡丹单瓣品种偏多的状况，从根本上解决了品种失调的问题。随着油用牡丹产业的兴起，采用工厂化嫁接速繁优良单瓣油用牡丹品种是解决油用牡丹优良母本苗不足的重要手段。