不同用途分类相对于繁殖方法也有所不同。

观赏类用途的牡丹品种由于对花型和色彩要求非常严格，一般要求遗传性能必须稳定，有性繁殖品种受不确定杂交授粉机率影响较大，不能保证品种的纯正性。无性繁殖技术才能保证观赏品种的遗传不变异，因此国内外均以嫁接繁殖技术生产观赏品种，技术要求较高，成本代价也高。

药用类用途的牡丹品种其生产产品的目的是取根作丹皮，以根条生长繁茂、易剥皮达到药用疗效好的品种为上品。目前看凤丹品种仍为最优良品种，繁殖方法以有性籽播苗进行生产，快速、简易、成本低。

油用牡丹品种类用途以采籽榨油为主要生产目的，种籽产量高低为第一标准，其次为出油率和油品营养成份。从目前笔者研究的成果看，凤丹品种和紫斑牡丹品种是目前油用牡丹产业快速发展中唯一可选择的的两个品种。凤丹品种结籽期早于紫斑牡丹品种且结籽率高于紫斑牡丹品种。而紫斑牡丹品种的出油率和油品质量（α-亚麻酸含量）高于凤丹的品种。

从习性上区别，凤丹品种抗湿热，紫斑牡丹抗严寒干旱。通过甘肃中川牡丹产业有限公司前些年收购凤丹品种的根作砧木（价格便宜）来嫁接繁殖优良紫斑牡丹观赏品种的过程中，一部分凤丹生长旺盛，它们与紫斑牡丹自然杂交后繁殖的杂交后代其中有些品种继承了母本和父本的作为油用牡丹品种要求的特性，既能结籽又具较强抗寒性，生长适应范围广，油品质量也比较好，这种品种是现有条件下北方或南方最好的油用牡丹新品种。

但总体看，在油用牡丹快速发展的新形势下，南方发展以凤丹为主的油用牡丹品种为好，北方寒冷地区以发展甘肃抗寒油用牡丹品种为好。